Wissenschaftliche:r Mitarbeiter:in (m/w/d) im Bereich Bioinformatik
Kennziffer: 2025-0007
- Freiburg
- Vollzeit
- DKTK Partnerstandort Freiburg - Institut für Medizinische Bioinformatik und Systemmedizin des Universitätsklinikums Freiburg
„Forschen für ein Leben ohne Krebs“ – das ist unsere Aufgabe am Deutschen Krebsforschungszentrum. Wir erforschen, wie Krebs entsteht, erfassen Krebsrisikofaktoren und suchen nach neuen Strategien, die verhindern, dass Menschen an Krebs erkranken. Wir entwickeln neue Methoden, mit denen Tumore präziser diagnostiziert und Krebspatient:innen erfolgreicher behandelt werden können. Jeder Beitrag zählt – ob in der Forschung, in der Administration oder der Infrastruktur. Das macht unsere tägliche Arbeit so bedeutungsvoll und spannend.
Gemeinsam mit universitären Partnern an sieben renommierten Partnerstandorten haben wir das Deutsche Konsortium für Translationale Krebsforschung (DKTK) gegründet.
Am DKTK Partnerstandort Freiburg haben wir ab sofort eine freie Stelle als
Im Rahmen des DKTK spielen Joint Fundings eine zentrale Rolle. Diese Forschungsprojekte sind ein fester Bestandteil der wissenschaftlichen Arbeit in Freiburg und zeichnen sich durch die enge, standortübergreifende Zusammenarbeit innerhalb des DKTK aus.
Das Translationszentrum ist in den Räumlichkeiten des Instituts für Medizinische Bioinformatik und Systemmedizin des Universitätsklinikums Freiburg angesiedelt.
Ihre Aufgaben:
Die ausgeschriebene Tätigkeit umfasst die Entwicklung und Anwendung bioinformatischer Methoden zur Analyse und Integration heterogener Omics-Datensätze, wie Genomik, Transkriptomik und Mikrobiom-Daten. Ziel ist es, Biomarker und Krankheitsmerkmale zu identifizieren, die für die Diagnose, Patientenselektion und Therapieempfehlungen von Bedeutung sind. Ein Schwerpunkt liegt auf der Auswertung von Patienten- und Organoiddaten sowie der Korrelation von Mikrobiom-Daten mit Tumormerkmalen und molekularen Subtypen (z. B. CMS, MSI).
Zur Erfüllung dieser Aufgaben werden maschinelle Lernverfahren und statistische Modelle eingesetzt, um Krankheitsstadien, Signalwegaktivitäten und Biomarker zu charakterisieren und prädiktive Modelle zu entwickeln. Weitere Tätigkeiten umfassen die Nutzung von Zelltypdekonvolutionstools zur Analyse der Tumormikroumgebung und die enge Zusammenarbeit mit interdisziplinären Teams, beispielsweise in molekularen Tumorboards, um translationale Ansätze in der Krebsforschung voranzutreiben.
Abgerundet wird das Aufgabenprofil durch die Validierung von Biomarkern und Modellen an unabhängigen Datensätzen sowie die Entwicklung strategischer Ansätze zur gezielten mikrobiellen Bekämpfung, die langfristig zur Prävention und Therapie von Krebserkrankungen beitragen könnten.
Ihr Profil:
- Abgeschlossenes Studium in einer Naturwissenschaft (z. B. Bioinformatik, Physik, Informatik, Mathematik)
- Erfahrung in der Bioinformatik (Auswertungen von Sequenzierungsdaten aller Art, insbesondere DNA-Seq, RNA-Seq, Proteomik, Mikrobiomik)
- Kenntnisse in der Analyse und Interpretation von Mikrobiom-Datensätzen
- Erfahrung im Anwenden von Methoden der künstlichen Intelligenz
- Interesse an biologischen / medizinischen Fragestellungen und Bereitschaft zu interdisziplinärer Arbeit
- Schnelle Auffassungsgabe und selbstständiges Arbeiten
- Umfassende Kenntnisse in wissenschaftlicher Programmiersprache (z. B. R, Python)
- Ausgeprägte Kommunikationsstärke sowie Organisations- und Teamfähigkeit
- Selbstständige und zielorientierte Arbeitsweise, Zuverlässigkeit und die Bereitschaft, Neues zu lernen
- Deutsche und englische Sprachkenntnisse
Unser Angebot:
- Hervorragende Rahmenbedingungen: modernste state-of-the-art Infrastruktur und Möglichkeit zum internationalen Austausch auf Spitzenniveau
- 30 Tage Urlaub
- Flexible Arbeitszeiten
- Vergütung nach TV-L inkl. betrieblicher Altersvorsorge und vermögenswirksamer Leistungen
- Möglichkeit zur mobilen Arbeit und Teilzeitarbeit
- Familienfreundliches Arbeitsumfeld
- Nachhaltig zur Arbeit: Vergünstigtes Deutschland-Jobticket
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Miriam von Scheibner
Telefon: +49 (0)761/270-84673
