Postdoc - Single-Cell Sequencing and Bioinformatics
Kennziffer: 2025-0024
- Düsseldorf
- Full-time
- DKTK partner site Essen/Düsseldorf - Junior Research Group "Cancer Bioinformatics and Multiomics"
„Forschen für ein Leben ohne Krebs“ – das ist unsere Aufgabe am Deutschen Krebsforschungszentrum. Wir erforschen, wie Krebs entsteht, erfassen Krebsrisikofaktoren und suchen nach neuen Strategien, die verhindern, dass Menschen an Krebs erkranken. Wir entwickeln neue Methoden, mit denen Tumore präziser diagnostiziert und Krebspatient:innen erfolgreicher behandelt werden können. Jeder Beitrag zählt – ob in der Forschung, in der Administration oder der Infrastruktur. Das macht unsere tägliche Arbeit so bedeutungsvoll und spannend.
Together with university partners at seven renowned partner sites, we have established the German Cancer Consortium (DKTK).
We are seeking for the Junior Research Group "Cancer Bioinformatics and Multiomics" at the DKTK partner site Essen / Düsseldorf a
Cancer Bioinformatics and Multiomics is a junior group located at the Universitätsklinikum Düsseldorf. We apply third-generation and single-cell sequencing technologies to address questions relating to aberrant transcriptional processes in diverse cancers.
Ihre Aufgaben:
We are looking for a highly motivated postdoctoral scientist with a hybrid background in computational biology and single-cell/genomic science at the bench. The successful applicant will join a DFG-supported collaborative project to conduct single-cell in vivo CRISPR screens on gastric cancer patient-derived organoids transplanted into mouse models to search for epigenetic modulators of tumorigenesis and metastasis. Responsibilities include carrying out 10X Chromium single-cell sequencing and preparing CROP-seq libraries, identifying enriched sgRNAs via UMI sequencing, and performing downstream bioinformatic analysis such as gene-set enrichment analysis of hits, identification of somatic copy number alterations, elucidation of tissue-specific drivers of metastasis, determining the relationship between primary progenitor cells and their metastases, and assessing the role of the tumor microenvironment.
Ihr Profil:
We are looking for exceptional candidates with a completed M.Sc. and Ph.D degree in the areas of molecular or cell biology, medical science, biochemistry, biophysics, computational biology, or similar programs. Preference will be given to those candidates with demonstrated experience performing and/or analyzing CRISPR screens or single-cell RNA sequencing data. The candidate should have previous experience in scRNA-seq data analysis tools such as Seurat, Scanpy, MAST, scCN, and MOFA for multiomic analyses. Since our team is international, strong written and spoken English is essential. German is desirable but not required. We value analytical thinking, flexibility regarding the tasks, responsibility, attention to detail, and above all teamwork skills.
Unser Angebot:
- Hervorragende Rahmenbedingungen: modernste state-of-the-art Infrastruktur und Möglichkeit zum internationalen Austausch auf Spitzenniveau
- Vergütung nach TV-L inkl. betrieblicher Altersvorsorge und vermögenswirksamer Leistungen
- 30 Tage Urlaub
- Flexible Arbeitszeiten
- Möglichkeit zur Teilzeitarbeit
- Familienfreundliches Arbeitsumfeld
- Nachhaltig zur Arbeit: Vergünstigtes Deutschland-Jobticket
- Unser betriebliches Gesundheitsmanagement bietet ein ganzheitliches Angebot für Ihr Wohlbefinden
- Entfalten Sie Ihr volles Potenzial: Zugang zum DKFZ International Postdoc Program und dem DKFZ Career Service mit gezielten Angeboten für Ihre persönliche Entwicklung fördern Ihre Talente
Sie sind interessiert?
Dr. David Koppstein
Telefon: +49(0)211 811-7644
Bewerbungen per E-Mail können leider nicht angenommen werden.
Bitte beachten Sie auch, dass wir per Post eingereichte Bewerbungen nicht zurückschicken können.
