Postdoc – Bioinformatics / Computational Biology

Kennziffer: 2025-0144

• Heidelberg
• Full-time
• Signaling and Functional Genomics

„Forschen für ein Leben ohne Krebs“ – das ist unsere Aufgabe am Deutschen Krebsforschungszentrum. Wir erforschen, wie Krebs entsteht, erfassen Krebsrisikofaktoren und suchen nach neuen Strategien, die verhindern, dass Menschen an Krebs erkranken. Wir entwickeln neue Methoden, mit denen Tumore präziser diagnostiziert und Krebspatient:innen erfolgreicher behandelt werden können. Jeder Beitrag zählt – ob in der Forschung, in der Administration oder der Infrastruktur. Das macht unsere tägliche Arbeit so bedeutungsvoll und spannend.

At the earliest date possible the Division of  Signaling and Functional Genomics is looking for a 

We are seeking a Postdoctoral Researcher with expertise in bioinformatics and computational analysis to join the Division of Signaling and Functional Genomics led by Prof. Michael Boutros at the German Cancer Research Center (DKFZ) in Heidelberg, Germany. Our group is pioneering novel methods for high-throughput genetic and pharmacological perturbations to systematically analyze signaling pathways and gene-drug interactions. In order to decipher the genetic and gene-drug interactions, we use model systems like Drosophila, human cell cultures, and patient-derived organoids in high-throughput screens (e.g., RNAi, CRISPR/Cas9, small molecules). In this context, we also develop new computational tools for automated analysis and data visualization. These include algorithms and software applications for RNAi and CRISPR reagent identification and off-target prediction (E-RNAi, E-CRISP), and public databases of functional screening data (GenomeRNAi, GenomeCRISPR), which are also part of the ELIXIR service portfolio. Further projects in the group are based on integrative analysis of multi-omics data, such as RNASeq (bulk or single-cell) and long-read genomics data.

Ihre Aufgaben: 

Are you passionate about bioinformatics and eager to work in an interdisciplinary team? In our group you will work on the following tasks:

• Develop and adapt bioinformatics approaches for experimental design, data analysis, and integration of genomic data sets
• Design the concept of analysis workflows for high-throughput screens and integrative analysis
• Maintain and further develop software tools and databases for high-throughput screening experiments and add new content based on literature
• Support the group in analyzing multi-omics data, such as RNASeq and images
• Analyse and present the results
• Collaborate with internal and international collaboration partners
• Support and administer internal web- and Linux servers

Ihr Profil:

• Academic degree (master and PhD) with a background in computer science, bioinformatics, physics, or related field
• Proven experience in omics data analysis
• Knowledge of Bioconductor/R for biological data analysis
• Experience in object-oriented software development and building of modern web-based applications
• Good analytical and (bio)statistical skills
• Knowledge of relevant programming languages such as Java, Python, and Perl
• Good knowledge of relational and document-oriented database design (e.g., MySQL, MongoDB)
• Experience with Git and Docker containers
• Knowledge of Django and workflow management systems (e.g., Snakemake or Nextflow) is beneficial
• Proficiency in applying artificial intelligence methods to biomedical data is a plus
• Experience in image processing techniques, such as segmentation, is of advantage
• Ability to quickly grasp new concepts and work independently on complex problems
• Ability to work as part of an interdisciplinary team but also independently
• Excellent communication, organizational, and interpersonal skills
• An excellent written and oral command of English is essential

The application shall include a CV, a letter of motivation, degree certificates and names, and contact information of at least two references.

Unser Angebot:

Sie sind interessiert?

 ​Befristung: Die Stelle ist zunächst auf 2 Jahre befristet. Eine Verlängerung ist möglich.

Bewerbungsschluss: 26.06.2025

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Bitte beachten Sie auch, dass wir per Post eingereichte Bewerbungen nicht zurückschicken können.

Wir sind davon überzeugt: Ein innovatives Forschungs- und Arbeitsumfeld lebt von der Vielfalt seiner Beschäftigten. Daher freuen wir uns über Bewerbungen von talentierten Menschen, unabhängig von Geschlecht, kulturellem Hintergrund, Nationalität, ethnischer Zugehörigkeit, sexueller Identität, körperlichen Fähigkeiten, Religion und Alter. Menschen mit Schwerbehinderung werden bei gleicher Eignung bevorzugt.

 

Hinweis: Wir unterliegen den Vorschriften des Infektionsschutzgesetzes (IfSG). Deshalb müssen alle unsere Beschäftigten einen Immunitätsnachweis gegen Masern vorlegen.

 

 

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