Position: Softwareentwickler:in / Bioinformatiker:in (m/w/d) Java / JEE

Department: Hochdurchsatzsequenzierung

Code number: 2024-0028

The German Cancer Research Center is the largest biomedical research institution in Germany. With more than 3,000 employees, we operate an extensive scientific program in the field of cancer research.

Für unsere Core Facility "Hochdurchsatzsequenzierung" suchen wir zur Verstärkung des bioinformatischen Teams zum nächstmöglichen Zeitpunkt eine:n Softwareentwickler:in oder Bioinformatiker:in (m/w/d) zur Weiterentwicklung unseres Labor-Informations- und Management-Systems (LIMS).

Als Core Facility innerhalb des Deutschen Krebsforschungszentrums bearbeiten wir den gesamten NGS-Workflow zur Durchführung von Genom-Sequenzierungen auf modernsten Sequenziersystemen und gehören zu den größten Einrichtungen dieser Art in Europa.

Wir bieten eine interessante und herausfordernde Tätigkeit in einem internationalen und expandierenden Arbeitsumfeld innerhalb eines positiv motivierten Teams. Sie erwarten vielseitige Herausforderungen, interessante Technologien sowie die Möglichkeit zur Mitwirkung an der Forschung für ein Leben ohne Krebs.


The German Cancer Research Center (DKFZ) is the largest biomedical research center in Germany. With over 3,000 employees, we conduct an extensive scientific program in the field of cancer research.

For our Core Facility "High-Throughput Sequencing" we are looking for a software developer or bioinformatician with strong software development background to strengthen our team and develop our Laboratory Information and Management System (LIMS).

As a core facility within the DKFZ, we handle the entire genome sequencing workflow on state-of-the-art systems and are one of the largest facilities of this kind in Europe.

We offer an exciting and multifaceted role in an international and growing working environment, within a positively motivated team. You can expect a variety of challenges, interesting technologies, and the opportunity to contribute to research for a life without cancer.

 

Job description:

  • Durchführung von Anforderungsanalysen im Team mit Mitarbeiter:innen des Labors und (Bio-)Informatiker:innen: Erhebung, welcher Bedarf in Bezug auf die Weiterentwicklung des LIMS besteht und Erarbeiten von Lösungen
  • Beteiligung an der Weiterentwicklung des LIMS von Planung bis Betrieb
  • Gestaltung von Softwarearchitekturen und Auswahl von Technologien
  • Anbindung an Laborgeräte, Sequenziermaschinen, HPC-Cluster und Datenspeicher im Petabyte-Bereich
     
  • Requirements analysis in a team comprised of laboratory staff and bioinformatics scientists: Determine user needs for the further development of the LIMS and work out solutions
  • Participation in the development of the LIMS from planning to operation
  • Design software architectures and select technologies
  • Implement connections to laboratory devices, sequencing machines, HPC clusters and data storage in the petabyte range

Requirements:

  • Erfolgreich abgeschlossenes Hoch- oder Fachhochschulstudium der Informatik, Bioinformatik oder eines vergleichbaren Studienganges
  • Gute Kenntnisse in der Programmiersprache Java (Java EE)
  • Fähigkeit zur Konzeption und Umsetzung einer Webapplikation
  • Erfahrung im Umgang und mit der Entwicklung von SQL-Datenbanken sowie den Entwicklungswerkzeugen Maven und Git
  • Kenntnisse in JSF 2.0 und idealerweise der Komponentenbibliothek PrimeFaces sind von Vorteil
  • Erfahrung im Bereich Testautomatisierung von Webanwendungen
  • Bonus: Interesse an Laborautomation oder Bioinformatik und Genomsequenzierung

Wir setzen ein selbstmotiviertes, ziel- und serviceorientiertes sowie sorgfältiges Arbeiten, alleine und im Team, und ein freundliches Auftreten voraus.

Die Fähigkeit und das Interesse zur fachübergreifenden Kommunikation auf Deutsch oder Englisch sind unerlässlich.
 

  • Successfully completed university or university of applied sciences degree in computer science, bioinformatics or a comparable course of study
  • Good knowledge of the programming language Java (Java EE)
  • Ability to design and implement web applications
  • Experience in handling and developing SQL databases as well as with Maven and Git
  • Knowledge of JSF 2.0 and ideally the PrimeFaces component library is advantageous
  • Experience in test automation of web applications
  • Nice to have: Interest in laboratory automation or bioinformatics and genome sequencing

We expect you to be self-motivated, goal- and service-oriented, as well as diligent in your work, both alone and as part of a team, and have a friendly demeanor. The ability and willingness for interdisciplinary communication in German or English is essential.

We offer:

  • Excellent framework conditions: state-of-the-art equipment and opportunities for international networking at the highest level
  • Remuneration according to TV-L incl. occupational pension plan and capital-forming payments
  • 30 days of vacation per year
  • Flexible working hours
  • Possibility of mobile work and part-time work
  • Family-friendly working environment, e.g. parent-child room, advisory services caring for elderly relatives
  • Sustainable travel to work: subsidized Germany job ticket
  • Unleash your full potential: targeted offers for your personal development to further develop your talents
  • Our Corporate Health Management Program offers a holistic approach to your well-being

Important notice:

The DKFZ is subject to the regulations of the Infection Protection Act (IfSG). As a consequence, only persons who present proof of immunity against measles may work at the DKFZ.

Earliest Possible Start Date: zum nächstmöglichen Zeitpunkt

Duration: The position is initially limited to 2 years with the possibility of prolongation.

Application Deadline: 05.03.2024

Contact:

Dr. Angela Schulz
Phone +49 (0)6221/42-3408

Please note that we do not accept applications submitted via email.

The DKFZ is committed to increase the proportion of women in all areas and positions in which women are underrepresented. Qualified female applicants are therefore particularly encouraged to apply.

Among candidates of equal aptitude and qualifications, a person with disabilities will be given preference.

To apply for a position please use our online application portal (https://www.dkfz.de/en/stellenangebote/index.php).

We ask for your understanding that we cannot return application documents that are sent to us by post (Deutsches Krebsforschungszentrum, Personalabteilung, Im Neuenheimer Feld 280, 69120 Heidelberg) and that we do not accept applications submitted via email. We apologize for any inconvenience this may cause.