Wissenschaftliche:r Mitarbeiter:in (m/w/d) im Bereich Bioinformatik
Reference number: 2025-0007
- Freiburg
- Vollzeit
- DKTK Partnerstandort Freiburg - Institut für Medizinische Bioinformatik und Systemmedizin des Universitätsklinikums Freiburg
“Research for a life without cancer" is our mission at the German Cancer Research Center. We investigate how cancer develops, identify cancer risk factors and look for new cancer prevention strategies. We develop new methods with which tumors can be diagnosed more precisely and cancer patients can be treated more successfully. Every contribution counts – whether in research, administration or infrastructure. This is what makes our daily work so meaningful and exciting.
Gemeinsam mit universitären Partnern an sieben renommierten Partnerstandorten haben wir das Deutsche Konsortium für Translationale Krebsforschung (DKTK) gegründet.
Am DKTK Partnerstandort Freiburg haben wir ab sofort eine freie Stelle als
Im Rahmen des DKTK spielen Joint Fundings eine zentrale Rolle. Diese Forschungsprojekte sind ein fester Bestandteil der wissenschaftlichen Arbeit in Freiburg und zeichnen sich durch die enge, standortübergreifende Zusammenarbeit innerhalb des DKTK aus.
Das Translationszentrum ist in den Räumlichkeiten des Instituts für Medizinische Bioinformatik und Systemmedizin des Universitätsklinikums Freiburg angesiedelt.
Your Tasks
Die ausgeschriebene Tätigkeit umfasst die Entwicklung und Anwendung bioinformatischer Methoden zur Analyse und Integration heterogener Omics-Datensätze, wie Genomik, Transkriptomik und Mikrobiom-Daten. Ziel ist es, Biomarker und Krankheitsmerkmale zu identifizieren, die für die Diagnose, Patientenselektion und Therapieempfehlungen von Bedeutung sind. Ein Schwerpunkt liegt auf der Auswertung von Patienten- und Organoiddaten sowie der Korrelation von Mikrobiom-Daten mit Tumormerkmalen und molekularen Subtypen (z. B. CMS, MSI).
Zur Erfüllung dieser Aufgaben werden maschinelle Lernverfahren und statistische Modelle eingesetzt, um Krankheitsstadien, Signalwegaktivitäten und Biomarker zu charakterisieren und prädiktive Modelle zu entwickeln. Weitere Tätigkeiten umfassen die Nutzung von Zelltypdekonvolutionstools zur Analyse der Tumormikroumgebung und die enge Zusammenarbeit mit interdisziplinären Teams, beispielsweise in molekularen Tumorboards, um translationale Ansätze in der Krebsforschung voranzutreiben.
Abgerundet wird das Aufgabenprofil durch die Validierung von Biomarkern und Modellen an unabhängigen Datensätzen sowie die Entwicklung strategischer Ansätze zur gezielten mikrobiellen Bekämpfung, die langfristig zur Prävention und Therapie von Krebserkrankungen beitragen könnten.
Your Profile
- Abgeschlossenes Studium in einer Naturwissenschaft (z. B. Bioinformatik, Physik, Informatik, Mathematik)
- Erfahrung in der Bioinformatik (Auswertungen von Sequenzierungsdaten aller Art, insbesondere DNA-Seq, RNA-Seq, Proteomik, Mikrobiomik)
- Kenntnisse in der Analyse und Interpretation von Mikrobiom-Datensätzen
- Erfahrung im Anwenden von Methoden der künstlichen Intelligenz
- Interesse an biologischen / medizinischen Fragestellungen und Bereitschaft zu interdisziplinärer Arbeit
- Schnelle Auffassungsgabe und selbstständiges Arbeiten
- Umfassende Kenntnisse in wissenschaftlicher Programmiersprache (z. B. R, Python)
- Ausgeprägte Kommunikationsstärke sowie Organisations- und Teamfähigkeit
- Selbstständige und zielorientierte Arbeitsweise, Zuverlässigkeit und die Bereitschaft, Neues zu lernen
- Deutsche und englische Sprachkenntnisse
We Offer
Excellent framework conditions: state-of-the-art equipment and opportunities for international networking at the highest level
30 days of vacation per year
Flexible working hours
Remuneration according to TV-L incl. occupational pension plan and capital-forming payments
Possibility of mobile work and part-time work
Family-friendly working environment
Sustainable travel to work: subsidized Germany job ticket
Unleash your full potential: targeted offers for your personal development to further develop your talents
Our Corporate Health Management Program offers a holistic approach to your well-being
Are you interested?
Then become part of the DKFZ and join us in contributing to a life without cancer!
Miriam von Scheibner
Phone: +49 (0)761/270-84673
We are convinced that an innovative research and working environment thrives on the diversity of its employees. Therefore, we welcome applications from talented people, regardless of gender, cultural background, nationality, ethnicity, sexual identity, physical ability, religion and age. People with severe disabilities are given preference if they have the same aptitude.
